RodrYC Si, actualmente la extensión esta diseñada de esta manera, el JavaScript de la página se carga después de que se cargue el contenido de la página, por lo que no hay forma de comprobar si un archivo JavaScript se ha cargado o no.
Es un problema muy comentado respeto a esta extensión, los desarrolladores son conscientes de ello así que es probable que el rediseño de la extensión tenga mucho trabajo y por eso no hay novedades sobre ello, estaré atento por si sale alguna actualización o sustituto de esta extensión que permita JavaScript.